胶质母细胞瘤驱动基因相关的竞争性内源RNA调控网络

来源 :中国临床神经外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：vbwu

【摘要】

：

目的探讨胶质母细胞瘤(GBM)驱动基因相关的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络。方法从癌症基因组图谱(TCGA)中下载169例GBM及5例正常组织长链非编码RNA(lncRNA)表达数据,从UCSC X

【作者】

：

张春雨叶立果王龙袁凡恩彭泽生陶野陈谦学田道锋

【机构】

：

武汉大学人民医院神经外科,长江航运总医院神经外科

【出处】

：

中国临床神经外科杂志

【发表日期】

：

2020年9期

【关键词】

：

胶质母细胞瘤竞争性内源RNA 癌症基因组图谱生信分析 GlioblastomaCompeting endogenous RNALong non-coding

【基金项目】

：

湖北省卫生和计划生育科学研究项目(WJ2017M019)

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目的探讨胶质母细胞瘤(GBM)驱动基因相关的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络。方法从癌症基因组图谱(TCGA)中下载169例GBM及5例正常组织长链非编码RNA(lncRNA)表达数据,从UCSC Xena数据库下载509例GBM及10例正常脑组织微小RNA(miRNA)表达数据。对获取的lncRNA及miRNA表达数据进行差异表达分析。GBM的17个驱动基因是从文献(PMID:30096302)中获得。miRcode,TargetScan,miRTarBase和miRDB数据库预测lncRNA、m

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