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为精确便捷的测量同步信号相位差的大小和稳定性,文中设计了一款基于FPGA的高精度同步信号测量系统。提出了一种在时钟频率较低的情况下提高相位差测量分辨率的算法,算法的实现和系统的控制用FPGA来完成。该系统能够精准地测量并储存两路同步信号在某段时间内产生的相位差,可用LCD显示,也可在上位机上画出某段时间相位差变化曲线,以便对同步信号的可靠性做出更精准的评估。系统已用于某矿区地质勘探仪的同步信号的测量中。