基于词汇化随机文法模型的RNA二级结构预测

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针对经典的随机文法模型预测RNA二级结构存在精度不高的问题,本文给出了一种词汇化随机文法模型预测RNA二级结构的方法。首先,用最大熵模型获取RNA序列中的词条信息,通过Viterbi算法搜索每个词条被标注为某种二级结构类型的最大概率;然后,将这些词条信息作为先验信息在随机文法模型训练过程中引入,从而加快对二级结构的搜索过程,提高准确率。
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