目的:研究内蒙古自治区医疗保障支出与卫生总费用之间的关系。方法:利用内蒙古自治区2009—2014年的相关数据作为样本,分别运用灰色绝对关联度、灰色相对关联度以及灰色综合关联度三种分析方法对医疗保障支出与卫生总费用之间的关系进行研究,具体细化为四类关系:(1)医疗保障总支出与卫生总费用的关联度分析;(2)政府医疗保障支出与卫生费用的关联度分析;(3)社会医疗保障支出与卫生费用的关联度分析;(4)商业医疗保障支出与卫生费用的关联度分析。结果:从卫生总费用角度,对于内蒙古自治区医疗保障支出,政府卫生支出高于社会卫生支出的关联度;从医疗保险基金筹资角度,对于内蒙古自治区医疗保障支出,城镇居民基本医疗保险基金与新型农村合作医疗保险基金的关联度较高;从人均医疗保健消费与个人现金支出角度,与内蒙古自治区医疗保障支出的关联度从大到小依次顺序为:个人现金卫生支出、农村居民人均医疗保健消费、城镇居民人均医疗保健消费。结论:卫生总费用结构日益合理,政府医疗保障支出所占比重与日俱增,居民个人现金卫生支出仍相对较高。内蒙古自治区医疗保险基金筹资城乡不均。