【摘 要】
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从拟南芥数据库中获得GELP基因家族注册号,运用生物信息学分析的方法,在茶树数据库中得到了GELP基因家族成员86个,这些基因可分为9个亚族.其编码蛋白的氨基酸数为171～753,理论等电点为4.35～9.48,蛋白质分子量为18.59419～84.55054 kDa.基因结构分析表明,有3条基因只有2个外显子,其余基因外显子数3～13.对上游2 kb区域启动子顺式作用元件分析表明,该基因家族成员对逆境胁迫应答MYB响应明显,除CsGELP16、CsGELP24、CsGELP56、CsGELP61、CsG
【机 构】
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信阳师范学院 生命科学学院/河南省茶树生物学重点实验室,河南 信阳 464000
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从拟南芥数据库中获得GELP基因家族注册号,运用生物信息学分析的方法,在茶树数据库中得到了GELP基因家族成员86个,这些基因可分为9个亚族.其编码蛋白的氨基酸数为171～753,理论等电点为4.35～9.48,蛋白质分子量为18.59419～84.55054 kDa.基因结构分析表明,有3条基因只有2个外显子,其余基因外显子数3～13.对上游2 kb区域启动子顺式作用元件分析表明,该基因家族成员对逆境胁迫应答MYB响应明显,除CsGELP16、CsGELP24、CsGELP56、CsGELP61、CsGELP77、CsGELP80外,其他基因均对抗寒元件识别位点MYC响应明显.转录组数据分析表明,CsGELP79、CsGELP64、CsGELP86、CsGELP4分别在Cold、PEG、NaCl、MeJA等处理下上调显著,表明基因CsGELP79响应寒冷胁迫,CsGELP64响应干旱胁迫,CsGELP86响应高盐胁迫,CsGELP4响应抵抗病虫害.此外,CsGELP1、CsGELP12、CsGELP14、CsGELP15、CsGELP18、CsGELP32、CsGELP55在各种处理下均表现为下调,说明这些基因在抗逆胁迫中起负调节作用.
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