丹参EST序列中SSR信息的分析及分子标记的建立

来源 :世界科学技术(中医药现代化) | 被引量 : 0次 | 上传用户:lt5185
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本文对从NCBI下栽的鼠尾草属11747条EST序列(其中,丹参10228条)进行分析,搜索到含SSR的序列1911条,共合有SSR2156个,出现频率为18.35%。在丹参EST—SSR中,核苷酸重复基元种类共77种。单核苷酸重复最多,出现频率为10.45%,二、三核苷酸的出现频率为3.72%、4.40%。三核苷酸重复中ACG/CTG为主要类型,占27.3%。共设计引物143对,合成13对(其中,丹参6对,Salvia fruticosa7对),在对引物、dNTP、MgCl2进行测试后,建立了合适的PC
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