通过宏基因组分箱方法揭示南极联合冰川土壤中ARG宿主

来源 :生态学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:delicioussmoke
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
抗生素抗性基因(ARGs)引起的抗菌素耐药性(AMR)对人类健康构成日益严重的威胁.准确鉴定ARG宿主对于评估AMR从环境向人类病原菌传播的风险至关重要,但目前对原始环境中ARG宿主的研究鲜有报道.本研究基于从NCBI下载的南极土壤宏基因组测序数据,利用宏基因组学组装和分箱技术对联合冰川地区中ARG宿主的分布、抗性机制与迁移潜力进行探究.结果 表明:在构建的80个MAGs中,有18个MAGs可携带86个ARGs(13种ARG类型),并以多抗耐药类、氨基香豆素、利福平、糖肽类和β-内酰胺类抗性基因为主,且不同的ARG类型呈现不同的宿主分布模式.在ARGs宿主中,共发现21个ACCs(ARG-carrying contigs)携带可移动遗传元件(MGEs),其中最常见MGEs的是移位酶,其次是转座酶、整合酶、接合转移蛋白和重组酶.这些MGEs可与ARGs形成特定的ARG-MGE共存模式,以多种方式促进抗生素耐药性的产生和传播.此外,埃希氏杆菌(Esche-richia)、伯克氏菌(Burkholderiaceae)及类诺卡氏菌(Nocardioides)可携带多种ARGs,是联合冰川土壤中重要的ARGs储存库.研究结果为环境中抗生素耐药性的风险评估和控制提供依据.
其他文献
木聚糖是自然界中含量最丰富的半纤维素,占木质纤维素生物质总量的25%~35%,具有转化合成高值化产品的巨大潜力.通过对木聚糖进行定向酶解,可以获得木寡糖、木糖和阿魏酸等多种功能组分.其中,木糖和阿魏酸可以作为多种可再生燃料和化学品的前体物质被进一步转化为高值化产品,进而广泛应甩于药品、化妆品、食品等领域.而木糖作为一种碳源,也可以直接用于微生物的发酵.本文首先介绍了木聚糖及其结构组成,分别描述了木聚糖水解酶及其酶解产物,进而系统综述了以木聚糖酶解产物木糖、阿拉伯糖、乙酸、阿魏酸、葡萄糖醛酸为底物生物合成不
恶性肿瘤严重危害人类健康,其发生发展与细胞调控失调、无限增殖密切相关.微小染色体维持蛋白(mini-chromosome maintenance proteins,MCM)家族是细胞周期中DNA复制的重要准许因子,与恶性肿瘤发生发展及侵袭关系密切,是细胞增殖活性的新型标志物.MCM7作为MCM家族中的一员,在癌症的发生与进展过程中呈过表达,对恶性肿瘤的诊断、治疗及预后具有重要意义,是一种潜在的肿瘤诊断标志物.本文阐述了MCM家族的生物学功能,并总结了MCM7近年来在恶性肿瘤中的研究进展,为其未来的临床应用
RNA结合蛋白HuR是胚胎致死性异常视觉基因(embryonic lethal abnormal vision gene,ELAVL)的蛋白质产物,在人体细胞中普遍表达.近年来,多项研究发现,HuR主要发挥稳定靶mRNA、促进靶mRNA翻译的作用,该生物学功能受HuR自身调节、转录后调控、翻译后修饰等多个水平的共同调控.此外,HuR亚细胞定位的改变与多种肿瘤的发生发展、疾病预后密切相关.本文旨在将HuR的研究进展作一简要概述,并探讨HuR在肿瘤的诊断及治疗中的潜在作用.
脱落酸(abscisic acid, ABA)是植物用来抵抗外界威胁的一种重要激素,它通过影响其信号通路中下游调控因子的转录和转录后修饰,控制植物对生物和非生物环境胁迫作出响应,从而增强植物的抗性。其核心反应首先是脱落酸受体接受脱落酸分子信号后,变构抑制蛋白磷酸酶2C(protein phosphatase 2C, PP2C)的活性,从而减轻或消除PP2C对蔗糖非发酵相关蛋白激酶2(sucrose
核糖体是蛋白质合成工厂,其效率(单核糖体对多种mRNA的翻译能力)和/或核糖体生物合成增加可通过上调核糖体翻译速率,进而促进蛋白质合成以诱导肌肉肥大.其中,核糖体生物合成是调节抗阻运动诱导骨骼肌纤维肥大的关键限速因素之一.研究表明,急性抗阻运动既可通过激活mTOR及其下游信号通路增加核糖体翻译效率,在一定时相内又可促进核糖体生物合成.长期抗阻训练则可在上调核糖体生物合成的同时,增加核糖体的量及其翻译能力,最终引起骨骼肌在训练期间及之后显著肥大.本文对抗阻运动经核糖体生物合成诱导骨骼肌肥大的作用及机制进行了
肠道微生物区系是肠-皮肤轴的主要调节因子,可以将肠道与炎症性皮肤病联系起来.调节肠道微生物区系可改善肠道微环境,进而影响皮肤健康.虽然越来越多的证据证明了肠-皮肤轴的存在,但他们之间的作用机制还有待阐明.本文总结了肠道微生物与三种常见皮肤病——痤疮、特异性皮炎、银屑病相互作用的最新进展,与此同时提出了补充益生菌和改善饮食成分作为潜在参与者改善皮肤健康的策略.
课程是人才培养的核心要素.微生物学作为特色食品专业集群的通识课程,具有较强的实践性和应用性,但在地方本科高校转型的背景下,课程建设存在诸多不足.因此,针对各专业特点和职能需求,以能力培养为本位,从搭建多学科交叉融合研究平台,优化重构教学内容、强化实践教学、创新多元化考核评价体系等方面对微生物学课程建设进行了探索,以全面提升教学水平,实现专业培养目标.
随着信息技术的发展,“互联网+”逐渐融入并改变了我们的生活,教育作为“互联网+”时代下深受重视的领域,为我国教育教学改革带来新的发展契机,也为提升生物化学教学效果和学生科研素养提供了新思路.为加快信息技术与生物化学课程的融合,湘雅医学院针对医学生在生物化学教学中开展了多层次的线上线下混合式教学,优化了教学方法和内容,改变了传统教学组织形式,依托慕课(MOOC)平台,构建了线上线下相融合的课程考核与评价体系,为了使教学精益求精,还建立了小规模限制性在线课程(SPOC).通过实践证明,湘雅医学院生物化学线上线
穿心莲(Andrographis paniculate(Burm.F.)Nees)具有抗菌、消炎和抗病毒等功能,但其种植和生产中的连作障碍对其药材的产量和质量产生不利影响.本研究通过田间试验,在连作5年的穿心莲连作地设置1.2 kg·m-2(C1)、2.4 kg·m-2(C2)添加量的竹炭处理,以不添加竹炭的穿心莲连作地为对照(C0),在采摘期测定植株农艺性状指标,利用Illu-mina Miseq高通量测序方法,研究其根际土壤细菌种群结构、丰度及多样性.结果 表明:施加竹炭有利于连作土壤中穿心莲的生长,
死亡相关蛋白(Thanatos-associated proteins,THAP)家族的许多成员已被证实与细胞增殖、凋亡和癌症密切相关,而THAP8的功能尚不清楚.为了探究THAP8在癌症中的表达,对TCGA和Oncomine数据库进行了分析,发现THAP8 mRNA在肺癌组织的表达显著高于癌旁正常组织;接着采用荧光定量PCR技术分析了22对肺癌和癌旁正常组织中THAP8的表达差异,结果与数据库分析一致.为了探讨THAP8在肺癌组织中高表达的原因,用JASPAR软件预测THAP8启动子上的转录因子结合位点