MALDI-TOF MS技术和AFLP技术在肺炎链球菌同源性分析中的应用

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目的 探讨基质辅助激光解吸飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术和扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术在肺炎链球菌的鉴定和同源性分析中的应用.方法 收集2016年11月-2017年12月泉州市儿童妇幼保健院临床分离的52株肺炎链球菌标本,用全自动细菌鉴定仪和Optochin试验进行鉴定验证,分别使用MALDI-TOF MS技术和AFLP技术进行同源性分析,形成聚类树,研究两种方法在肺炎链球菌同源性分析中的应用.结果 MALDI-TOF MS技术检测52株细菌均为肺炎链球菌.经过IVD MALDI Biotyper软件获得聚类树图,分为两大簇包括Ⅰ型13株、Ⅱ型39株,其中Ⅱ型又分为两小簇(Ⅱa型24株、Ⅱb型15株).AFLP技术检测52株肺炎链球菌基因组DNA样本,以电泳条带位置计算出样本间的遗传距离,建构样本的系统发育树,分为两大簇包括Ⅰ型1株、Ⅱ型51株,其中Ⅱ型又分为两小簇(Ⅱa型48株、Ⅱb型3株).结论 MALDI-TOF MS技术能准确、快速鉴定肺炎链球菌;Biotyper软件进行同源性分析十分快速、便捷,按照0.5差异水平,与AFLP技术的结果有一致性,但也存在差异.
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