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全基因组SNP交互作用中的基因型差异分析
全基因组SNP交互作用中的基因型差异分析
来源 :高等数学研究 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong550
【摘 要】
:
为了描述基因型差异,本文从卡方检验入手求解相关度,并利用多位点连锁不平衡度,建立比较函数来区分个体差异;从1000人基因组计划数据库中收集了25个SNP位点,建立基于遗传算法
【作 者】
:
张胜利
王华依
柴源君
葛江诚
【机 构】
:
西安电子科技大学数学与统计学院
【出 处】
:
高等数学研究
【发表日期】
:
2019年1期
【关键词】
:
SNP/交互作用
卡方检验
人群分类模型
遗传算法
改进BP神经网络
SNP/gene-gene interactionchi-square testgenet
【基金项目】
:
国家自然科学基金(11601407),西电教改重点项目(A1618).
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为了描述基因型差异,本文从卡方检验入手求解相关度,并利用多位点连锁不平衡度,建立比较函数来区分个体差异;从1000人基因组计划数据库中收集了25个SNP位点,建立基于遗传算法改进BP神经网络进行人群分类,实现了输入某样本的SNP基因型,输出该样本的地区来源.
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