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苹果茎痘病毒（Apple stem pitting virus,ASPV）是一种严重危害果树生产的潜隐性病毒。基于前期研究所获得的6个ASPV中国分离物CP基因的核苷酸序列,结合GenBank中报道的序列,对ASPV种群遗传多样性特点进行分析。应用MEGA 4.0软件分析了不同地理来源、不同寄主来源组内和组间的各分离物CP基因的遗传多样性,表明ASPV种群遗传变异与寄主来源、地理分布不存在明显的相关性。CP编码区仍处于净化选择中,亚洲的分离物、梨分离物承受着较高的选择压力。DnaSP软件分析显示,ASPV