人工养殖对尼罗罗非鱼肠道菌群的影响

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试验旨在研究人工养殖对尼罗罗非鱼肠道菌群的影响。研究采用16S rDNA测序方法对野生(YS)和人工养殖(YZ)尼罗罗非鱼的肠道内容物进行测序,分析比较两者肠道菌群生物丰富度及多样性差异。结果表明,在野生环境下,尼罗罗非鱼肠道中Actinobacteriota、Proteobacteria和Firmicutes为主要优势菌群;在人工养殖环境下,Actinobacteriota、Proteobacteria和Cyanobacteria为主要优势菌群。肠道菌群多样性的分析表明,YZ组群落多样性指数低于YS组(P<0.05)。门水平上,YZ组的Proteobacteria、Acidobacteriota、Bacteroidota和NB1-j菌门低于YS组(P<0.01或P<0.05),Cyanobacteria、Dependentiae高于YS组(P<0.01或P<0.05)。属水平上,YZ组的norank_f_norank_o_Chloroplast、 Mycobacterium、 Paeniclostridium、 IMCC26207、 Methylocystis和Conexibacter菌属高于YS组(P<0.01),Exiguobacterium、norank_f_Steroidobacteraceae、norank_f_SC-I-84菌属低于YS组(P<0.01)。Spearman相关分析结果表明,在门分类水平上,环境因子对不同分组样本中物种数据分布的影响排序为pH值>NH4-N>NO2-N>O>PO4-P。在属分类水平上,环境因子对不同分组样本中物种数据分布的影响程度排序为NO2-N>NH4-N>pH值>O>PO4-P。研究表明,人工养殖会改变尼罗罗非鱼的肠道菌群,有助于解释肠道菌群对养殖和野生环境下尼罗罗非鱼健康和生长的影响。
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