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赤潮可以严重危害海洋渔业、海水养殖业和旅游业，甚至危害到人类的生命健康，它的频繁发生已经引起各国政府的高度重视。虽然可以通过每日多次实时检测海水的水文、化学要素等来推测发生赤潮的可能性，但是这些方法都不能直接反映有害赤潮藻的种类和数量，从而不能为赤潮监测和预报提供最直接的参考数据。实际上，对海水中的藻类进行分类、鉴定和数量分析是监测和预报赤潮发生的最直接有效的方法，这包括对水样采集、藻种类鉴定、毒性鉴定和赤潮藻定量计数等。传统的形态分类技术可以解决赤潮监测中的多数问题,