参薯GID1基因的挖掘和特征分析

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参薯为薯蓣科薯蓣属,是热区重要的薯类作物,具有很高的营养价值和药用价值。GID1基因是赤霉素受体蛋白,在植物的生长和发育中起关键作用。本研究采用生物信息学方法对参薯基因组中GID1家族基因进行鉴定,并对该基因结构、系统进化、保守基序以及表达模式等进行分析,通过分子实验筛选DELLA2-PGBKT7自激活抑制剂3-AT的浓度,酵母双杂交实验验证参薯GID1的互作基因。结果表明,参薯基因组中含有4个GID1家族成员,各成员都含有1个内含子。系统进化结果显示,单子叶和双子叶植物的GID1蛋白处于两个不同分支,参薯中GID1C-1和GID1C-4处于同一分支,GID1C-2和GID1C-3处于同一分支。保守基序分析发现,参薯中GID1C-1和GID1C-4含有10个完整的蛋白保守序列。表达模式分析结果显示,DaGID1C-1和DaGID1C-4在块茎、叶片和零余子中表达较高。分子实验表明:随着菌液稀释倍数和3-AT浓度的增加,DELLA2-PGBKT7自激活抑制效果显著。酵母双杂交实验表明,DELLA2是GID1C-1和GID1C-4的互作基因。
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