基于生物信息学分析癫痫脑内星形胶质细胞炎性激活机制

来源 :现代预防医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:anchor1989
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目的 挖掘癫痫脑内星形胶质细胞异常炎性激活的关键信号分子,为进一步阐明神经免疫促痫机理提供生物信息学基础.方法 NCBIGEO数据库获取癫痫动物模型(GSE73878)和星形胶质细胞炎性激活细胞模型(GSE73022)基因芯片结果,GE02R在线筛选共有差异表达基因(DEGs),DAVID数据库进行GO功能模块和KEGG通路富集分析,STRING数据库和Cytoscape软件构建DEGs蛋白质互作网络,多算法筛选Hub基因,最后利用GEPIA数据库在易发癫痫的低级别胶质瘤患者中验证.结果 两芯片交集共获得72个DEGs,主要富集在调控免疫反应、细胞因子活力等过程,病毒感染类似信号、Toll样受体信号等通路;59个基因可构成大的蛋白互作网络,其中24个基因组成核心模块,多算法筛选结合GEIPA数据库发现Gbp3、Ifit3、Irf7、Stat1是Hub基因.结论 癫痫脑内星形胶质细胞异常炎性激活与Gbp3、Ifit3、Irf7、Stat1等基因关系密切,其可能是调控癫痫脑内神经免疫促痫过程的新靶点.
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