动力学方法研究Imatinib与蛋白激酶的结合构象与结合自由能

来源 :西华师范大学学报：自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：aigeng87

【摘要】

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对imatinib两种典型复合物晶体结构imatinib．Abl与imatinib—c．Kit进行比对分析，并利用MM／PBSA方法计算imatinib与Abl、c-Kit、c-Src、p38及Syk等激酶的结合自由能．计算结果表明，im

【作者】

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杨丽君刘茜袁文彬文丰玉

【机构】

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化学合成与污染控制四川省重点实验室西华师范大学化学化工学院

【出处】

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西华师范大学学报：自然科学版

【发表日期】

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2012年3期

【关键词】

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IMATINIB 蛋白激酶结合自由能动力学 Imatinib Protein kinase Binding free energy Dynamics

【基金项目】

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基金项目：四川省教育厅自然科学重点项目（11ZA294）,西华师范大学科研启动基金资助项目（No：108006）.

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对imatinib两种典型复合物晶体结构imatinib．Abl与imatinib—c．Kit进行比对分析，并利用MM／PBSA方法计算imatinib与Abl、c-Kit、c-Src、p38及Syk等激酶的结合自由能．计算结果表明，imatinib与上述激酶结合时，范德华作用对结合自由能有主要贡献；其中，imatinib与激酶c-Kit结合自由能最低；imatinib与非活性构象激酶的结合自由能明显低于与活性构象激酶的结合自由能．

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