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2007年10月，我国新疆维吾尔自治区阿勒泰地区富蕴县发现马匹出现呼吸道疾病，发病马表现出典型的流行性感冒症状。经过临床诊断、病原分离、电镜观察以及病毒基因序列分析，确定病原为马流行性感冒病毒，属于H3N8亚型，该株病毒与近年来马流行性感冒病毒北美洲流行株的同源性较高，命名为A／equine／xinjiangFuyun／3／2007（H3N8）。