目的：探讨分析功能性消化不良患者的神经因素以及临床治疗效果。方法对比72例功能性消化不良患者与同期72例健康体检者的精神心理状态评分、自主神经功能试验值等指标，并将72例功能性消化不良患者按治疗方法分为两组，治疗组42例，对照组30例，分别采用抗抑郁药联合治疗与内科常规治疗，治疗时间均为4周，对比分析两组的治疗效果。结果72例功能性消化不良患者抑郁、焦虑心理状态的异常评分与正常健康体检者相比，差异显著（P＜0．05）；两组深呼吸心率差、立卧位心率差等自主神经功能试验值对比差异显著（P＜0．05）；服用抗抑郁药的治疗组患者总有效率显著高于对照组（P＜0．05）。结论功能性消化不良患者往往存在抑郁焦虑情绪以及迷走神经功能障碍症状，临床上对该疾病患者进行常规内科治疗联合应用抗抑郁药能有效治疗FD，不良反应少而轻，值得临床上进一步推广与研究。