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针对我国各省份研发投入产出效率差异过大的问题,构建了区域研发经费资源优化配置模型,基于生产函数理论拟定了目标函数,根据模型的非线性特征,提出了用于求解的改进粒子群算法。根据1998年至2017年的统计数据,对我国31个省份进行模型有效性分析,预测2025年的研发经费总量并进行优化配置。研究结果表明,模型是有效的,2025年的研发效率和能力的格局会发生变化。