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人类runt相关转录因子3（RUNX3）基因是新近发现的一种抑癌基因，目前认为其失活的主要机制是高甲基化和杂合性缺失。RUNX3基因可能为转化生长因子-β（TGF-β）转导通路中的一个重要环节，参与TGF-β上皮细胞生长的负调控。大量研究已表明RUNX3与胃癌、肺癌、内胚窦癌、胰腺癌、胆管癌、肝癌、结肠癌、前列腺癌等多种肿瘤的发生发展有密切关系，并且RUNX3基因启动子的过度甲基化是导致RUNX3低表达，促进肿瘤发生发展的一个重要因素。