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作者回顾了我国(包括台湾地区)果蝇分类和系统发生重建(phylogenetic reconstruction)研究的历史,并着重介绍了过去约30年来,我国学者在这两个研究领域取得的新进展,总结了以上两方面工作当前所面临的任务和挑战,以及DNA条形码(DNA barcoding)技术在果蝇分类、系统发生研究中的意义.最后,作者提出了基于基因组/转录组测序来进行果蝇主干系统发生框架(basal phylogenetic framework)重建、进而基于获得数据,采用常规分子系统学方法解决较低层次系统发生问题的研究策略.