【摘 要】
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通过Hi-seq 2000高通量测序(high throughput sequencing,Hi-seq)获得金钱鱼的转录组数据,利用获得的转录组数据进行金钱鱼线粒体基因单核苷酸多态性(single-nucleotide poly
【基金项目】
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高等学校博士学科点专项科研基金资助项目(20133104110004),科技部"中国-东盟海水养殖中心"重大国际合作项目
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通过Hi-seq 2000高通量测序(high throughput sequencing,Hi-seq)获得金钱鱼的转录组数据,利用获得的转录组数据进行金钱鱼线粒体基因单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)的鉴定和分析。根据生物信息学的应用方法,对RNA-seq数据进行分析和筛选,得到金钱鱼线粒体基因组90个位点上的93个SNP。其中,在9个蛋白编码基因(ND1、ND2、COⅡ、ATP6、ND4L、ND4、ND5、ND6、Cytb)上均有SNP位点,而基因
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