【摘 要】
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目的采用生物信息学方法,对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃癌转录组数据进行分析,构建胃癌预后评估模型,筛选影响胃癌发生及预后的生物标志物。方法从TCGA数据库下载胃癌转
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(81660415),内蒙古自然科学基金资助项目(2016MS0835).
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目的采用生物信息学方法,对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃癌转录组数据进行分析,构建胃癌预后评估模型,筛选影响胃癌发生及预后的生物标志物。方法从TCGA数据库下载胃癌转录组数据及临床病理资料(胃癌样本375例,癌旁正常样本32例)并合并成矩阵,采用R“edgeR”包筛选差异表达基因(DEGs),采用R“Survival”包对DEGs进行Cox单因素、多因素回归分析,构建胃癌预后评估模型。结合临床病理特征,验证该模型在预后评估中的有效性。结果基于“edgeR”包共筛选出4332个DEGs,纳入Cox单因
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