茶树EST资源中SSR的信息分析

来源 :科技通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ggooddII
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
从NCBI公共数据库下载获得1989条茶树EST,去除其中的低质量的和冗余的序列,得到全长为734.54kb的1589条无冗余EST。共在这些序列中发掘出了281个EST.SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%。这些EST-SSR的平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61 kb。茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复。本研究为茶树EST-SSR标记的建立和进一步应用奠定了基础。
其他文献
以黄鳝为材料。研究了不同浓度的乙酸铜对黄鳝外周血白细胞数目、红细胞微核和核异常、以及肝脏过氧化氢酶(CAT)活性的影响。结果发现:在低剂量范围内,随着乙酸铜剂量的增加红细
家蚕滞育发生于胚胎发育早期,为卵滞育型,由遗传和环境条件支配。在蛹期由咽下神经节合成和分泌的滞育激素,在其滞育过程中起到了决定性作用。滞育激素编码基因的表达,引发咽
本文总结了射阳县蔬菜工厂化育苗的现状,比较了传统育苗和工厂化育苗的优缺点,分析了工厂化穴盘育苗中存在的一些问题,提出了进一步发展工厂化育苗的策略。
目的:建立同时测定橘叶中川陈皮素、橘红素、5-去甲川陈皮素含量的反相高效液相色谱法。方法:采用Kromasil C18(250 mm×4.6 mm,5μm)色谱柱,流动相为甲醇-乙腈-水(体积比30