【摘 要】
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候选基因关联研究中基因-基因、基因-环境交互作用的统计分析有利于揭示疾病的发生机制.本文针对病例对照设计的候选基因关联研究,综述交互作用的统计方法及其进展.交互作用
【机 构】
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复旦大学公共卫生学院劳动卫生学教研室,上海,200032上海中医药大学预防医学教研室,上海,201203;
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候选基因关联研究中基因-基因、基因-环境交互作用的统计分析有利于揭示疾病的发生机制.本文针对病例对照设计的候选基因关联研究,综述交互作用的统计方法及其进展.交互作用的统计方法包括参数法和非参数法.参数法中最常用的为Logistic回归模型,非参数法主要是数据挖掘方法.有4类数据挖掘方法可用于候选基因关联研究,包括降维法、基于树的方法、模式识别法和贝叶斯法.本文对最常用且可靠的几种数据挖掘方法(多因子降维法、分类回归树、随机森林、贝叶斯上位效应关联图谱)的原理、分析过程和优缺点予以比较.参数法和非参数法分析交互作用时各有优缺点;低维数据的分析可采用参数法和非参数法,高维数据的分析则主要采用非参数法.随着基因分型技术的发展,可检测的SNP规模逐渐增大,使得非参数方法的应用越来越广.
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