基于ESTIMATE算法和生物信息学分析挖掘卵巢癌免疫治疗关键基因

来源 :广西医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：xiaotian521

【摘要】

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目的:通过生物信息学方法从TCGA数据库挖掘卵巢癌(OV)免疫治疗的关键生物标志物。方法:从TCGA数据库下载OV基因表达谱,使用ESTIMATE算法评估免疫浸润细胞的得分。利用R软件包

【作者】

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黄小珏吴林桦莫柳慧党裔武刘丽敏

【机构】

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广西医科大学药学院,广西医科大学第一附属医院

【出处】

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广西医科大学学报

【发表日期】

：

2020年5期

【关键词】

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ESTIMATE 生物信息学卵巢癌免疫治疗预后关键基因 GFI1 ESTIMATEbioinformaticsovarian cancerimmunot

【基金项目】

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国家自然科学基金资助项目(No.81560489)

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目的:通过生物信息学方法从TCGA数据库挖掘卵巢癌(OV)免疫治疗的关键生物标志物。方法:从TCGA数据库下载OV基因表达谱,使用ESTIMATE算法评估免疫浸润细胞的得分。利用R软件包进行差异表达基因(DEGs)分析,通过Metascape工具进行一系列基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因百科全书(KEGG)通路分析、反应组学基因集(Reactome Gene Sets)和经典通路(Canonical Pathways)等富集分析,并对富集分析结果进行层次聚类和生存分析。结果:DEGs分析得到117

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