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《云南中医学院学报》系由云南省教育厅主管,云南中医学院主办的全国中医药优秀期刊,中国高等医药学院校优秀学报,全国高校自然科学优秀学报,被《中国学术期刊综合评价数据库》、《中国科学引文数据库》、《中国期刊网》、《中国学术期刊（光盘版）》、《中国核心期刊遴选数据库》等数10种国家权威检索期刊和数据库收录。