【摘 要】
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通过分析枣属植物酸枣叶绿体基因组密码子使用偏性,探讨影响其密码子使用偏性形成的主要因素。结果表明:酸枣叶绿体基因组有效密码子数(N ec)为47.72,密码子使用偏性较弱;中
【基金项目】
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山西省高等学校科技创新项目(2019L0369);山西农业大学博士科研启动项目(2017YJ22);山西省优秀博士来晋工作奖励项目(SXYBKY201742)
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通过分析枣属植物酸枣叶绿体基因组密码子使用偏性,探讨影响其密码子使用偏性形成的主要因素。结果表明:酸枣叶绿体基因组有效密码子数(N ec)为47.72,密码子使用偏性较弱;中性绘图分析和使用的有效密码子数绘图分析(N ec-plot绘图分析)结果表明,酸枣叶绿体基因组密码子使用保守性较高,选择压力对密码子使用的影响较大;最优密码子分析确定UUU、GUA、UCA、ACA、AAU、AGA、GGG等7个密码子为最优密码子;奇偶偏差分析表明,密码子第3位碱基的使用存在偏好性,嘌呤的使用比嘧啶更频繁;基于同义密码子
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