沼液和沼渣可作为优质有机肥提供作物营养，刺激和调节作物生长，对某些病害和虫害具有防治作用，并能增强作物抗病性，沼气燃烧后产生的CO₂用以气体施肥，能够提高作物产量，所有这些作用是通过沼渣、沼液作为底肥、追肥、叶面肥、浸种等方式实现的。
　　
　　一、沼液漫种
　　
　　适用于水稻、小麦、玉米、菜籽、瓜籽等种子。
　　浸种前晒种1－2天，以便提高种子吸收性能和杀灭部分病菌。选择正常产气3个月以上的沼气池。清除水压间杂物，用透水性较好的纺织袋包装种子，每袋15－20千克。并留出一定袋容、扎紧袋口，放入出料间中下部。水稻一次性浸种48小时，无壳种子(玉米)浸12－18小时，小麦种一般在17－20℃浸6－8小时。取出种子袋，将其外部冲洗干净。取出种子晾干、催芽。
　　
　　二、沼液叶面肥
　　
　　适用于果树、水稻、小麦等农作物。蔬菜喷施量宜小些。使用正常产气3个月以上的沼气池，沼液需过滤。在早晨8－10点喷施，尽可能喷在叶子背面。根据作物的长势确定喷施量和喷施时间。
　　
　　三、CO₂气体肥
　　
　　适用于温室大棚蔬菜，选用燃烧完全的沼气灯作为施气工具，在春、夏两季的每天早晨6点钟，在保护地燃沼气灯。到8点钟左右停止施放。然后关闭温室大棚1、5－2个小时，待棚温升至30℃时即开棚放风。一架30米长的大棚，点燃沼气灯6只，1小时后，棚内内CO₂浓度达1200微克／克。在早春季节还可提高棚温2－4℃，叶片光合强度增加5％－18％。应用沼气增施CO℃，可使黄瓜、西红柿、甜椒平均分别增产49％、21、5％、36％，并且能够延长生长期。
　　
　　四、沼渣
　　
　　1、种蘑菇
　　在种蘑菇进行堆料前20天，将沼气池内的结壳层，沼渣全部捞起，留下清液，出料前5天停止向池内投放新料。捞起的沼渣随即摊开，晒干、拍碎。按每平方米15千克稻草加10千克干沼渣的比例分层堆料，沼渣与麦草的配合比为1：0、5，再用沼液泼洒到湿润。出菇前每平方米菇床喷20％－40％的沼液0、5－0、75千克，1－2天喷一次，其他操作同常规栽培。
　　
　　2、种西瓜
　　适时播种，播前精选种子晒1－2天。用塑料袋装好，放入沼气池出料间浸泡8－10小时，取出轻搓1分钟左右，洗净催芽。用一份沼渣加一份土的营养土制成营养钵。施足茎肥，适时定植。施足冬基肥，每亩2500千克沼渣肥，均匀铺于瓜垄表面后深翻入土，在苗达6片叶时定植，定植前半个月，再施1500千克沼渣肥，根据情况补充50千克钾、磷肥，浅翻入土。定苗活棵后追1－2次沼液，每次500千克左右，1千克沼液兑2千克清水，行间点施，瓜苗出藤后。重施一次果肥，比例是100千克腐熟饼肥，50千克沼肥、10千克钾肥、开10厘米左右的沟，施后覆土，第一批西瓜收获后，用稀释沼液进行根外追肥，7－10天追一次。