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安康瀛湖湿地保护区由于建设进度缓慢和管理落后等原因,湿地功能下降和水环境污染的趋势没有得到有效遏制,保护区面临着社区居民的生产活动、河道采挖沙石和沙金、工业污水、生活污水、航运船只的燃料和排放物、陆路和水上交通运输活动等多方面的威胁,通过分析这些威胁因子,有针对性地提出了保护管理的对策。