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目的：分析有窦型与无窦型根尖周炎感染根管内菌群结构的差异。方法：采集17例原发性根尖周炎的根管样本，其中有窦型9例、无窦型8例。分别经DNA抽提和16SrRNA基因V3区PCR扩增后，利用变性梯度凝胶电泳（DGGE）检测两组样本的微生物群落结构；然后分别采用聚类分析、主成分分析（PCA）和偏最小二乘法（PLS）对两组样本的菌群结构进行比较，并对两组间有显著差异的相关区别条带进行割胶测序。结果：聚类分析、PCA、PLS显示，有窦型与无窦型样本的菌群结构存在差异，共有5条区别条带的检出水平在两组间显著不同（P