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云南西双版纳素有“物种基因库”的美称，是稻种资源的多样性中心区和优异种质富集区之一。本研究利用8个位于Rf-1位点的PCR分子标记对53份西双版纳地方籼稻、粳稻和光壳稻种质资源的遗传多样性和遗传分化进行了分析，共检测到15种多态性扩增片段。Shannon’s信息指数和Nei’s遗传多样性指数分析表明西双版纳水稻地方品种在Rf-1位点具有较高的遗传多样性，这些遗传变异主要来自于不同品种之间的遗传差异。分析表明西双版纳籼稻的遗传多样性要显著高于粳稻和光壳稻。结果还表明籼稻与粳稻和光壳稻之间的分化要显著大于粳稻