Bt cry序列本地数据库的建立及本地BLAST的实现

来源 :城市道桥与防洪 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zhangyong09

【摘要】

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根据研究的实际需要,运用winSDK设计了一个可视化的BLAST接口程序,利用此程序可以构建本地核酸和蛋白序列数据库与进行本地BLAST.在此基础上建立了苏云金芽孢杆菌(Bt)cry基因

【出处】

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城市道桥与防洪

【发表日期】

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2004年期

【关键词】

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生物信息学 cry基因本地核酸序列数据库本地BLAST

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根据研究的实际需要,运用winSDK设计了一个可视化的BLAST接口程序,利用此程序可以构建本地核酸和蛋白序列数据库与进行本地BLAST.在此基础上建立了苏云金芽孢杆菌(Bt)cry基因的本地核酸序列数据库,并进行了本地BLAST.与先前文献中介绍的本地BLAST实现的方法相比,此方法操作简便、并可根据实际需要随意定制相关数据库;在与NCBI的BLAST进行比较后发现,本地BLAST还具有个性化、准确性强、可信度高等特点.

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