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近年来随着我国经济实力的综合发展，医药商业企业合并的显现逐渐普及，但是一些医药商业企业在合并过程中存在一些比较特别的情况。在医药商业企业的合并中相关的法律条文和流程比较复杂，医药商业企业在税务处理、税务筹划的方面都有着较为明显的差异性。在激烈的市场竞争中医药商业企业的合并也是医药商业企业经济转型和医药商业企业结构调整的重要措施，在医药商业企业合并中会计和税务处理的方面需要格外的注重，医药商业企业需要根据实际的合并情况对税务处理和税务筹划上进行优化现有的处理措施以及办法，以此来降低医药商业企业合并中的风险。