【摘 要】
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目的应用GINI筛选微卫星不稳定型大肠癌中新的突变基因。方法采用NMD抑制药物emetine(依米丁)联合actinomycin D(放线菌素D),分别处理高度微卫星不稳定型(MSI-H)大肠癌细胞株
【机 构】
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复旦大学附属肿瘤医院病理科-复旦大学上海医学院肿瘤学系,Centre Leon Berard肿瘤医院分子肿瘤学实验室,Centre Leon Berard肿瘤医院分子肿瘤学实验室,Centre Leo
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目的应用GINI筛选微卫星不稳定型大肠癌中新的突变基因。方法采用NMD抑制药物emetine(依米丁)联合actinomycin D(放线菌素D),分别处理高度微卫星不稳定型(MSI-H)大肠癌细胞株HCT116和微卫星稳定(MSS)的大肠癌细胞株HT29,以及对照的MSS乳腺癌细胞株,以全基因组cDNA芯片检测经药物处理和不经药物处理的细胞株的mRNA表达变化。经过芯片数据分析筛选在HCT116细胞中mRNA表达量特异性升高的基因,以DNA直接测序法检测突变,并在22个大肠癌细胞株及30例原发癌组织中验证。结果在MSI-H大肠癌细胞株HCT116中筛选出新的突变基因ARV1和ZNF294,并在8个MSI-H细胞株中验证其突变率分别为37.5%和87.5%,在20例MSI-H原发大肠癌组织中突变率均为35%。结论基于NMD抑制的新的基因筛选方法GINI,能够相对快速、有效的检出发生突变的基因。
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