【摘 要】
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本研究用直接测序法,以尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)基础群体和快长群体父母本为材料进行生长激素促分泌素受体基因(growth hormone secretagogue receptor,GHSR)单核
【机 构】
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中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室; 上海海洋大学水产与生命学院; 广东省淡水名优鱼类种苗繁育中心;
【基金项目】
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现代农业产业技术体系专项资金(No.CARS-49);十二五国家科技支撑计划项目(No.2012BAD26B03-02);广东省科技计划项目(No.2012A020602017);广州市科技计划项目(No.2013J4100078和No.201300000064)
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本研究用直接测序法,以尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)基础群体和快长群体父母本为材料进行生长激素促分泌素受体基因(growth hormone secretagogue receptor,GHSR)单核苷酸多态性(single nucleotide polymophisms,SNPs)位点的筛选;再以两群体的子代为材料,采用snapshot法对筛选到的SNPs进行基因分型,并利用一般线性模型(general linear model,GLM)对基因型与生长性状进行相关性分析。结果表明,从两个尼罗罗非鱼群体的GHSR基因中共获得S1(A-409G)、S2(G-424T)、S3(T-553A)、S4(T-1114A)和S5(A-1168C)等5个SNPs位点,且均分布于该基因5′侧翼区。SNPs基因型与尼罗罗非鱼子代生长指标关联性分析结果表明,当S4位点为AA或AT基因型时,尼罗罗非鱼个体的体重、体长、体高、头长、尾柄长和尾柄高等生长指标均显著大于S4位点基因型为TT的个体(P<0.05),快长群体子代中S4位点AT基因型频率最高(55%),而在基础群体子代中TT基因型频率最高(75.94%)。5个SNPs位点不同基因型组成了7种双倍型(D1~7),其中D3和D5双倍型个体的体重、体长、体高、头长、尾柄高等生长指标显著高于D4和D7双倍型个体(P<0.05);而D1(体宽除外)、D2(体宽和尾柄长除外)和D6(体高除外)双倍型个体与其他双倍型个体之间在生长指标上均无显著差异(P>0.05)。快长群体子代和基础群体子代中的优势双倍型分别为D3双倍型(46.25%)和D4双倍型(35.44%)。因此,尼罗罗非鱼GHSR基因中S4位点处AA、AT基因型及双倍型D3、D5与快长性状密切相关,可作为尼罗罗非鱼分子标记辅助育种的候选标记。
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