【摘 要】
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链霉菌FT05W是一株对烟草黑胫病等土传真菌病害具有良好拮抗作用的生防放线菌。本研究利用Miseq PE300高通量测序平台对链霉菌FT05W基因组进行序列测定,共获得6914188个reads
【机 构】
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贵州大学农学院,贵州大学烟草学院,贵州大学昆虫研究所/贵州省山地农业病虫害重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金(31701836);贵州省烟草公司重大科技专项(201603);贵州省科技厅基础研究计划(2018-1050);贵州省烟草公司科技项目(201826);贵州省黔西南州烟草公司科技项目(201804)
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链霉菌FT05W是一株对烟草黑胫病等土传真菌病害具有良好拮抗作用的生防放线菌。本研究利用Miseq PE300高通量测序平台对链霉菌FT05W基因组进行序列测定,共获得6914188个reads,通过SPAdes软件对序列进行拼接共得1836个contigs,其基因组全长为7699129 bp,GC比为71%,其中编码基因序列长度为6037181 bp,预测出7434个蛋白编码基因(GenBank登录号:NZ_QGMR00000000),预测编码7323个蛋白。获得的基因注释信息为今后深入开展其在烟草上的
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