【摘 要】
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目前冠心病在全球范围内仍是一个庞大的群体,严重危害人类生命和健康.三七总皂苷(tPNS)作为临床的常用处方药广泛应用于冠心病、高脂血症等血管性疾病的治疗中.目的 该文将通过生物信息学预测三七总皂苷所调控的miRNA的标靶基因,并分析其所参与的生命过程,以探讨三七总皂苷通过miRNA治疗冠心病作用机制.方法 通过中国知网检索三七总皂苷调控的miRNA,并通过mirDIP数据库(http://ophid.utoronto.ca/mirDIP/index.jsp)得到miRNA对应标靶基因,并有3个以上数据库验
【机 构】
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辽宁中医药大学研究生学院,辽宁沈阳110847;辽宁中医药大学医学检验学院,辽宁沈阳110847
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目前冠心病在全球范围内仍是一个庞大的群体,严重危害人类生命和健康.三七总皂苷(tPNS)作为临床的常用处方药广泛应用于冠心病、高脂血症等血管性疾病的治疗中.目的 该文将通过生物信息学预测三七总皂苷所调控的miRNA的标靶基因,并分析其所参与的生命过程,以探讨三七总皂苷通过miRNA治疗冠心病作用机制.方法 通过中国知网检索三七总皂苷调控的miRNA,并通过mirDIP数据库(http://ophid.utoronto.ca/mirDIP/index.jsp)得到miRNA对应标靶基因,并有3个以上数据库验证标靶关系.经CooLGeN数据库(http://ci.smu.edu.cn/CooLGeN/Home.php)获得冠心病靶点.再利用Venny 2.1软件(http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html),获得miRNA标靶基因与冠心病靶点的交集.再将得到共同靶点在STRING平台(https://string-db.org/)构建PPI(protein-protein interaction)网络模型,明确蛋白相互关系.使用生物学信息注释数据库DAVID(https://david.ncifcrf.gov/summary.jsp)进行生物功能和通路分析.最后,利用Cytoscape 3.2.1软件,构建主要药物成份-miRNA-靶点-信号通路网络图.结果 通过中国知网检索,得到三七总皂苷调控的主要miRNA有miR-let-7b、miR-21、miR-155、miR-34a,经过mirDIP数据库得到miR-let-7b、miR-21、miR-155、miR-34a对应标靶基因,再利用Venny 2.1软件获得miR-let-7b、miR-21、miR-155、miR-34a标靶基因与冠心病靶点的交集有341个,其中包括CAMTA1,PDCD4,IL6R,THBS1等靶点.经STRING平台得到蛋白相互关系.经过DAVID数据库,显示核心靶点与细胞凋亡过程、基因表达、炎症反应的正向调节等生物过程密切相关.结论 三七总皂苷通过调控miRNA网络,进而影响多种蛋白质表达,参与炎症、凋亡等生命过程,以治疗冠心病.该研究结果为揭示临床应用三七类中药治疗冠心病的机制具有一定参考价值.
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