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RNA沉默是一种在真核生物中广泛存在的防御机制，它的一个主要作用是抗病毒。为了阐明这个机制，很多植物病毒的功能蛋白都被用来做RNA沉默抑制子的研究。RNA III聚合酶家族的Dicer在基因沉默机制中发挥关键的作用，不同的物种含有不同数量和种类的Dicer，可以将外源的mRNA切割成21-26nt的小片段，从而阻断外源基因的翻译途径，达到基因沉默的目的。病原物在进化的过程中，编码沉默抑制子蛋白，对抗寄主的基因沉默。沉默抑制子通过与寄主的蛋白或外源RNA等互作，抑制寄主的基因沉默。关于Dicer与沉默抑制子