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提出了一种基于最少残余点数法的干涉合成孔径雷达（InSAR）复图像配准新算法。通过分析引起干涉相位图残余点的因素，以及残余点与相位图的信噪比和平均波动函数之间的内在联系，提出可以用相位图的残余点数最少作为InSAR复图像配准的评价测度。新算法的计算量比传统的最大干涉频谱法要小而且更稳定，与平均波动函数法相比则计算量相当但不受相位跳变的影响。试验结果验证了新算法的有效性。