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炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)包括溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)和克罗恩病(Crohn's disease,CD)。病因至今不明,可能的病因包括由基因决定的宿主易感性、黏膜免疫和肠道微生态环境三者的相互作用。目前研究较多的是肠道菌群与IBD发病的关系。肠道微生物的有害作用可见于一些IBD的动物模型。在这些动物模型中,动物在无菌的环境中不发生肠道炎症。Harper等人曾报道如果把已行回肠造口术的CD患者的小肠流出物注入结肠,则诱导结肠炎