甲状腺癌关键致病基因筛选与预后分析及治疗中药的预测研究

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运用生物信息学方法,分析甲状腺癌的核心致病基因和关键预后基因,并预测可用于甲状腺癌靶向治疗的中药及活性成分。从GEO数据库下载甲状腺癌和健康人的基因芯片数据,用GEO2R工具,分析甲状腺癌和正常甲状腺组织间的显著性差异表达基因(DEGs);利用Metascape和GSEA数据库,分别对显著性DEGs进行GO和信号通路分析;采用GEPIA数据库,对显著性DEGs进行生存分析,筛选并验证甲状腺癌关键致病基因;运用TIMER数据库,探究关键致病基因表达与免疫浸润的关系;将关键基因导入Coremine数据库,挖掘可用于甲状腺癌靶向治疗的中药;通过CTD数据库,预测可用于甲状腺癌靶向治疗的中药活性成分。共筛选出393个显著性DEGs。显著性DEGs主要集中于肌肉收缩、对激素的反应、炎症反应等生物学过程,参与组成收缩纤维、肌质网、细胞间连接等细胞成分,影响免疫受体活性、信号素受体活性、趋化因子受体结合等分子功能。信号通路集中于细胞粘附分子、趋化因子信号通路、细胞因子受体相互作用、Fcγ R介导的吞噬作用等信号通路。对甲状腺癌预后有显著影响的DEGs为CLDN1、CXCL10、APOC1、CDH3、MYOT和AKR1C3,这些基因的表达与免疫浸润均显著相关。预测可用于甲状腺癌治疗的中药有黄芪、黄芩、半枝莲、野菊花、杜仲等。中药活性成分主要包括阿魏酸、小檗碱、芹菜素、木犀草素、山萘酚、黄芩素、人参皂苷等。本研究探寻到影响甲状腺癌发病及预后的关键基因,并进一步预测了可用于甲状腺癌治疗的中药,结果可为甲状腺癌的诊治提供新的分子生物标志物,并为甲状腺癌的临床治疗提供新思路。
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