鄱阳湖流域蚌类环境DNA宏条形码引物的筛选验证

来源 :湖泊科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：w19282

【摘要】

：

环境DNA技术是一种非侵入、高灵敏、高效率且对环境无破坏性,对生物体无损伤的调查工具.为了筛选适合于蚌类环境DNA生物多样性研究的宏条形码引物,本研究通过对鄱阳湖流域24种常见蚌的基因组DNA进行普通扩增和高通量测序筛选了11对引物(设计了9对通用引物及从相关文献中引用了2对引物),结果显示引物cyt b和16S rRNA具有良好的扩增效果和高辨别度.进一步用环境样本(n=6)并结合传统采样技术对这2对引物进行验证,结果表明:使用引物16S rRNA共注释到蚌科物种6属8种,蚌科物种序列占总序列数的26.

【作者】

：

陈金萍周春花欧阳珊黄晓晨吴小平

【机构】

：

南昌大学生命科学学院

【出处】

：

湖泊科学

【发表日期】

：

2021年4期

【关键词】

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环境DNA 生物多样性蚌类分子标记鄱阳湖流域

【基金项目】

：

国家重点研发计划“蓝色粮仓”重点专项(2018YFD0900801)资助.

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