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高通量测序在鸟类肠道微生物中的研究进展
高通量测序在鸟类肠道微生物中的研究进展
来源 :中国人兽共患病学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:junpenge
【摘 要】
:
鸟类作为分布广泛、种群数量庞大和高度多样化的物种之一,在病原体传播中发挥了重要作用。本文综述了基于高通量测序技术的3种测序策略(16S rDNA测序、宏基因组测序和宏转录
【作 者】
:
刘倩
宋文涛
樊国印
熊衍文
陈海婴
吴葵
【机 构】
:
南昌大学公共卫生学院,传染病预防控制国家重点实验室研究基地江西省动物源与媒介生物性传染病重点实验室南昌市疾病预防控制中心,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室
【出 处】
:
中国人兽共患病学报
【发表日期】
:
2020年12期
【关键词】
:
高通量测序
鸟类
肠道微生物
16S
rDNA
宏基因组
宏转录组
high-throughput sequencing
avian
gut microbiom
【基金项目】
:
国家科技重大专项(No.2018ZX10201001-006),传染病预防控制国家重点实验室自主研究课题(No.2019SKLID311)
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鸟类作为分布广泛、种群数量庞大和高度多样化的物种之一,在病原体传播中发挥了重要作用。本文综述了基于高通量测序技术的3种测序策略(16S rDNA测序、宏基因组测序和宏转录组测序)的特点及其在鸟类肠道菌群多样性、抗生素抗性基因和病原微生物发现中的应用,并对未来发展趋势进行了展望。
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