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目的：研究山东同一种植基地不同形态瓜蒌种子中的蛋白质。方法：采用紫外分析法测定蛋白质的含量,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术进行蛋白电泳分析,采用Biosens Gel Imaging System软件绘制指纹图谱。利用NTSYS-pc软件进行聚类分析,计算遗传相似系数。结果：不同样品的蛋白质含量具有明显差异,蛋白电泳图谱具有多条共有带。结论：种子蛋白质的含量不是评价瓜蒌质量优劣的主要指标,蛋白电泳图谱的共有条带可作为鉴定瓜蒌真伪的重要依据。