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利用2008—2019年广东制造业上市企业数据，通过门槛检验和回归等方法分析政府补贴对企业研发投入在企业异质影响下的政策效果。结论表明，政府补贴对企业研发投入有正向激励效应，但效应非线性呈门槛特征，补贴强度大于4.30%时效果更显著；同时，补贴对企业研发投入的影响分别存在以企业规模和股权集中度为控制变量的双门槛效应，具体表现为对资产小于6.712亿元的企业研发投入影响最显著，对股权集中度介于1.109与4.718之间的企业研发投入影响最显著，因此建议政府对企业研发补贴应结合企业特质系统决策以提高补贴效率。