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亲子鉴定和个体识别在生态学、进化学、遗传资源保存中意义非凡。迄今为止,基于多态性高的微卫星的亲缘排除仍是最为盛行的动物亲缘鉴定方法。近来年,单核苷酸多态性,因其低变异率和高分型准确性,成为系谱追溯的新秀。比较了微卫星标记和单核苷酸多态性标记在亲缘关系分析中的应用,以期为未来的分子进化、遗传保存研究以及育种体系的构建提供一些思考。