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2005～2009年对兴化湾水鸟资源进行调查,共记录到水鸟84种,隶属7目13科,以鸻鹬类、鸥类和雁鸭类为主,居留型以冬候鸟和旅鸟为主;拥有多种珍稀濒危水鸟,其中属于国家重点保护野生动物(1988)有10种、IUCN名录的有7种、中国濒危动物红皮书名录有9种。水鸟主要分布在江镜华侨农场、赤港华侨农场水产池塘和周边滩涂。同时,针对兴化湾水鸟情况提出了相应的保护对策。