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介绍了利用分子三维结构显示软件（Pymol）辅助进行生物分子结构与功能教学的应用经验,包括该软件的基本功能及使用方法,在氨基酸序列与蛋白质结构的定位与展示,生物大分子结构的多角度演示,基于分子结构的机理讲析等教学中的应用实例.教学实践表明,使用Pymol辅助教学清晰直观、生动活泼,对学生理解生物大分子的结构与功能,学好生化与分子生物学有很大帮助.