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以广东番禺和五山地区水稻植株中分离到的内生链霉菌为对象，调查可能存在的内源质粒。利用脉冲电泳技术从8个菌株中检测到大小在60kb～410kb的线型质粒，其中4个菌株的线型质粒可能有保守的端粒复制基因。该结果与土壤链霉菌中检测到线型质粒和具有保守端粒复制基因的比例相似，表明水稻植物组织内部的独特环境不会造成链霉菌线型质粒的多样性分布产生大的变化。此外，从13个菌株中检测到6kb～60kb的环型质粒。