【摘 要】
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目的分别应用5种方法进行血浆游离DNA的提取,从而判定与筛选最佳的血浆cfDNA提取方法。方法采集19例健康人血浆标本,针对每一样本取350μl血浆分别应用经1次/2次酚-氯仿-异戊
【机 构】
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吉林大学中日联谊医院中心研究室; 吉林大学基础医学院病理学教研室;
【基金项目】
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吉林省科技厅重大项目(20130727038YY);吉林省科技厅项目(20100942);吉林省科技厅项目(20110740);吉林省发改委项目(20101928)
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目的分别应用5种方法进行血浆游离DNA的提取,从而判定与筛选最佳的血浆cfDNA提取方法。方法采集19例健康人血浆标本,针对每一样本取350μl血浆分别应用经1次/2次酚-氯仿-异戊醇抽提法,经1次/2次酚-氯仿-异戊醇抽提配合微量DNA助沉剂法和介孔纳米磁珠法5种方法进行cfDNA提取,应用紫外分光法测定提取cfDNA的含量与纯度,应用实时荧光定量PCR方法以提取血浆cfDNA为模板进行扩增反应,以验证提取效果。结果应用5种方法从19例350μl血浆样本中提取的血浆cfDNA含量分别为(6971.43±1934.40)ng/ml、(2196.86±823.94)ng/ml、(12397.14±4197.37)ng/ml、(5568.29±1618.17)ng/ml和(7458.57±3706.83)ng/ml,A260/A280值分别为0.93±0.07、1.09±0.12、1.15±0.05、1.16±0.12和0.89±0.19,RT-qPCR扩增成功率为100%。结论经1次酚-氯仿-异戊醇配合微量DNA助沉剂法提取量大,纯度高,所提取的血浆cfDNA可以为RT-qPCR提供模板,进行后续实验。
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